電動暗幕の高さを短く変更できますか？

もちろん可能ですが特にその必要はないと思います。

電動暗幕の本体高さ（＝メカ部まで含んだスクリーンの長さ）は標準で最大2020mmとなっています。
電動暗幕の全体高さが2020mmというのは「最大でここまで降ろせる」という意味です。
初期設定にて下限位置設定を90cmの高さに設定することで問題無くご使用いただけますので通常高さ（2020mm）にてご注文ください。